博果爾再一次與鰲拜槓上了。鰲拜提議廢除新曆，逮捕湯若望等傳教士，博果爾反對這一對西洋傳教士趕盡殺絕的方案，並認為新曆已歷時二十餘年，足見其有效性，怎可就此摒棄，更何況這乃先帝盛譽過的人和事，如今先帝已逝，就全盤推翻，試問鰲拜居心何在？

博果爾第一次當眾全面闡述了自己對於西洋的看法，認為對西洋的東西應該區別對待，對於所謂的宣傳教義的行為自然就該加以管制，但同時應該更關注他們帶來的好處，比如說他們遠航的輪船，比如說火槍大炮，比如說開河修路等等一系列大清可以用得著的東西。

鰲拜不以為然，康熙卻聽得津津有味，他第一次發現除了洋文和幾何，原來西洋傳教士們還可以教授更多的東西，而這些東西才是大清現在迫切需要的。

最終事情得以完滿解決，博果爾也沒有過分駁了鰲拜的面子，湯若望等傳教士被抓進刑部大獄中蹲了十天，博果爾出面就《天學傳概》的歪門斜說訓斥了一番，並就西洋傳教士以後的傳教規模形式作了明確規定，最後才說聖上開恩寬恕了他們的罪過，如果再有下次就會把他們掃地出國門。而另一方面，玄燁擺出一副好學少年的模樣出來，哄騙得那班西洋傳教士一個個感念聖恩，搜心刮腸把自己肚子裡那點貨水倒出來，其中最厲害的就是南懷仁，而他也很快接替了癱瘓的湯若望任欽天監。

分久必合，合久必分，博果爾與鰲拜，不，是與四大輔臣，很快就在一件大事上達成共識。

康熙四年，玄燁十二歲，太皇太后已經早就開始為玄燁相看皇后人選，可從種種跡象表明，太皇太后與皇太后都希望科爾沁的女人繼續坐上皇后的寶座。這個，宗室不答應，滿州八旗也不答應，滿州自己多的是好姑娘，索尼的孫女、遏必隆的女兒可都是入選皇后的好人選，這下，連鰲拜都主動找上了博果爾，因為遏必隆的女兒同時也是他的乾女兒，還是博果爾的妻侄女。

商議之後，嶽樂與四大輔臣搞定太皇太后，讓她將選擇皇后的權利下放給皇上，而博果爾則負責搞定皇上，讓他一定要擇滿州女子為後。

玄燁畢竟是個天生當皇帝的料，他雖然一年來與三等公吉阿鬱錫家的格格極投緣，但他在聽了博果爾歷數了福臨身前後宮凡蒙古血統的女子均無所出時，不用博果爾說明說透，他已經領悟了博果爾的話中之意。確實，在太皇太后和皇太后都是科爾沁女人的時候，即使是為了後宮的平衡，也不能再讓蒙古女子坐上高位。

康熙四年三月，玄燁擇定索尼孫女、內大臣噶布喇之女赫舍里氏為皇后。太皇太后並不十分樂意，直到七月才下懿旨，行納采禮。九月，正式冊立赫舍里氏為皇后。

而在此之前，遏必隆的女兒被封為妃，而三等公吉阿鬱錫家的格格雖然也被選進宮，卻僅為庶妃。

七月，當博果爾以男方家長的身份往索尼府上代玄燁行納采禮後的次日，即上書請皇帝親政，留中未發。八月，博果爾與嶽樂共同上書，請皇帝親政，依舊留中未發。九月，兩大攝政王與四大輔臣共同上書，請皇帝親政。玄燁欣然同意。

康熙四年十月初一，康熙帝親政，御太和殿受賀，加恩中外，大赦。

即使是在兩年前就發下話來，玄燁大婚就讓政於他，可事到臨頭，博果爾發現自己也不是很樂意，甚至在第一次上書留中未發後還竊喜了一陣。不過，很快博果爾就冷靜下來，他這三百年見的貪權而死的人還少嗎？這樣想想，博果爾忽然有些感激起鰲拜來，這幾年來，他與鰲拜處處爭鋒相對，兩人都沒有拿到過絕對的權力，總是被對方制約住，或許這其中也有太皇太后或玄燁的作用在，但正是有了這種制約，才使得博果爾如此有勇氣放下手裡的權力。他不敢想象，如果有朝一日自己獨攬大權，只怕又會成為一個多爾袞