殺了齊王楊及其兩個兒子和燕王楊，隋朝的宗室、外戚，無論老幼一律殺死。只有秦王楊浩平時與宇文智及有來往，宇文智及想辦法保全了他。

齊王楊一向失寵於楊廣，特別是當年楊廣雁門關被圍之時，楊表現得上躥下跳，一直幻想著楊廣被突厥人殺死後他能當上皇帝，楊廣在事後瞭解這些事情後，便沒再給楊一點權力。

楊和楊廣父子兩人一直相互猜忌，一開始楊廣聽說起了亂事的時候，還曾對蕭後說過：“叛亂之人不會是阿孩（楊）吧？”

而當宇文化及派人到楊府第殺人的時候，齊王楊以為是楊廣下令來捕他，還道：“詔使暫且放開本王，本王沒有做對不起楊家江山的事！”

叛軍沒理會大吼大叫的楊，將他拖拽到街道中砍死，楊最終也不知道要殺他的是誰，父子之間至死也沒能消除隔閡。

亂兵又殺了御史大夫裴蘊、左翊衛大將軍來護兒、秘書監袁充、右翊衛將軍宇文協、千牛備宇文晶、梁公蕭鉅等人及其兒子。裴蘊臨死前的事後嘆息道：“沒想到與播郎（虞世基）商量，竟然誤了事！”

黃門侍郎裴矩因為平時對待作賤役的人也很優厚，又建議為驍果娶婦，所以在叛軍中有些人望，待亂事發生後，有人要殺裴矩，但一部分受過裴矩的亂兵卻道：“這不是裴黃門的錯，我們不該殺他。”

正爭執間，宇文化及到了，裴矩連忙迎到馬前行禮，因他從未得罪過宇文化及，宇文化及便出言相護，使得裴矩避免了禍事。

宇文化及因為蘇威不參與朝政，也放過了他。蘇威名聲、地位歷來顯赫，他去參見宇文化及，宇文化及集合眾人來見他，對他格外尊重。

給事郎許善心對蘇威道：“公向來敢於直言上諫，被認為是我朝的忠良，今卻又為何屈服於弒君者？難道你竟也是貪生怕死的人？”

許善心說到最後，言詞已甚為激烈。蘇威支吾半響，不能回答。

蘇威屈服於宇文化及，也不能說他不是隋朝的忠臣，只能說他比較識時務，不願白白送死罷了，比較這時楊廣已死，蘇威已無力迴天了。

不過總會有一些人，明知是死也要抗爭到底，完全將生死置之度外。

李淵入關時，張季的弟弟張仲琰是上洛令，帶領部下、百姓佔據城池抵抗，誓不投降，但最後被部下所殺。

宇文化及之亂，張季、張琮都為為千牛左右，宇文化及弒君後，張季、張琮都不願臣服於宇文化及，還對其大罵不止，宇文化及便讓人將張氏兄弟殺了。

名不經傳的張家兄弟三人，卻都死於國難，這令一些為了苟且偷生而對宇文化及卑躬屈膝的人感到十分羞愧。

十四日夜晚，經過一整天的殺戮，該誅殺的人基本都已全部殺掉了，百官都戰戰兢兢的到朝堂祝賀宇文化及，不過只有給事郎許善心沒到。

許善心的侄子許弘仁騎馬跑去告訴他道：“天子已經駕崩了，宇文將軍代理朝政，滿朝文武都集於朝堂，天道人事自有它相互代替終結的道理，又與叔叔您有什麼相干，何至於這樣流連不捨！”

許善心聽後很生氣，不肯去。許弘仁只好回身上馬，哭著走了。

宇文化及派人到家裡把許善心捉到朝堂上，不過一會兒又放了他。許善心不按朝見的規矩行禮就走出朝堂。

宇文化及生氣地拂袖道：“這人真是不知好歹！”於是又重新下令把許善心捉回朝堂，將其頭顱砍下。

許善心的母親範氏九十二歲了，撫摸著靈柩但並不哭泣，“能死國難，真是我的兒子！”範氏之後躺著不吃東西，於十幾天後去世。

四月十二日，宇文化及以蕭後的命令立秦王楊浩為皇帝，住在別宮，不過只是讓他簽署釋出詔敕而已，仍然派兵對其監守。