議會獲悉奧軍取勝，鼓起勇氣拋開了他們的中立立場，不僅對法國宣戰，而且還煽動他們在維羅納的黨羽在當地醫院慘無人道地屠殺法國傷兵。威尼斯軍隊越過邊界，截斷了拿破崙從後方獲得各類補給品的路線。查理大公決定趁這機會在首都與拿破崙決一死戰。

正當查理大公重整齊鼓時，維也納宮廷卻被拿破崙軍隊閃電般的推進嚇壞了。維也納到處都在傳揚著一句話：漢尼拔兵臨城下了。維也納宮廷一片驚慌，貴重物品和重要檔案已經開始運往匈牙利，奧皇弗蘭西斯二世準備向法國請求議和。

拿破崙乘勝猛追，一心想把共和國旗幟插上維也納城頭。他上書督政府，希望得到桑爾方面軍、蒙斯方面軍以及萊茵方面軍的配合和支援。但督政府批覆道，他不能指望德國境內能有牽制性攻勢，提及的各軍均不得渡過萊茵河。督政府還告訴拿破崙他們已同意奧皇的議和請求。拿破崙不得不停止。

4月7日，拿破崙的先頭部隊抵達累歐本。累歐本是奧地利斯蒂利亞省的一個城市，距維也納250公里。拿破崙寫信通知查理大公，表示準備議和。他在這封意味深長的信中，充分照顧了戰敗者的自尊心。他寫道，假如他能夠簽訂和約的話，那他所感到的自豪將會超過由於戰爭勝利而得到的微不足道的榮譽。〃難道我們殺害的人民還不夠多嗎？難道我們給可憐的人類帶來的災難還不夠深重嗎？〃很快，查理大公的參謀長別耳加德中將和梅爾委耳特少將以軍使身份來到法軍大本營，他們在同拿破崙會商後提出照會，內容如下：“將軍麾下，皇帝和國王陛下願意促使歐洲安寧，結束使兩大民族破產的戰爭。……在我們和您剛才進行的商談以後，皇帝深信兩國都有儘快結束這個災難性戰爭的善良願望。因此，他願意締結為期10天的停戰協定。”

拿破崙作為總司令同奧軍代表進行談判。當天晚上籤訂了為期5天的停戰協定。接著，拿破崙未等督政府派人前來媾和，便授權自己同奧地利代表談判和約的初步條款。4月18日，簽訂了累歐本臨時條款，戰爭以拿破崙的勝利而告終。

拿破崙自累歐本回師後，毫不留情地報復了出爾反爾的威尼斯。他派兵佔領了威尼斯，並改組了其政府，還向威尼斯索取了300萬法郎黃金、300萬法郎海軍物資、5艘戰艦、20幅最精美的油畫和500部珍貴的原稿。威尼斯的獨立地位再也不存在了。

6月29日，拿破崙宣佈在義大利北部以倫巴第為中心成立內阿爾卑斯共和國。在這裡，他廢除了奧地利的一套政府機構，組成了市政府和國民自衛軍。這個仿效法蘭西政體的共和國版圖北平阿爾卑斯山脈，南至裡米尼，西迄提契諾河，東抵明喬河。它成為法蘭西有力的同盟國。

約瑟芬的背叛拿破崙在遠征義大利期間，屢屢思念到他的新婚妻子約瑟芬，他利用休戰的點滴空閒給她寫了一封又一封充滿柔情蜜意的情書。他寫道：“我沒有一天不在愛你，沒有一個夜晚不在默默地思念你，在幻覺中將你摟入懷抱。每當我空閒，捧起茶杯，總要詛咒那使我遠離生命靈魂的榮譽感，我的心中只有你——可愛的約瑟芬，你佔據了我的心。如果說我與你猝然告別，一如羅訥河的急流，那是為了能快快與你團聚。每當夜闌人寂，我就起床工作，那也是為了儘快完成我的使命，重返你的身旁。〃〃離開了你，我就不知道什麼才是欣悅；離開了你，這世界就像是荒涼一片，我孤獨地站在其中，沒有任何人使我內心橫溢的情感有所慰藉；你是我生活的源泉，你束縛了我的肉體和靈魂；因此，我的生活目的，乃是為了你而活著。我所崇敬的約瑟芬！若我離開你太久，我就不能忍耐。我並不是十分勇敢的人，有些時候，我也曾誇口我的勇敢，可是現在，我想著我的約瑟芬就生了病。尤其是那你不會太愛我的恐怖幻想楔入我的精神，使我發狂，使