中的探險者在僥倖逃過一死後，幾乎都描述了一段極其強調孤立感的經歷，即使黑域遠征艦隊為此已做出充足的應對措施，利用類似絲路殖民地的舊軍政府制度管控黑域內的每個殖民據點，但隨著歸鄉之旅變得漫長，以及難以與太陽系政府有效聯絡的疏離下，一個乃至多個僅存在於黑域範圍內的分裂勢力開始萌芽，在歸鄉之旅進行的一個多世紀以來，遠征艦隊的敵人除了競爭者薛林佛人與黑域內的原住民文明，還需要與隱藏於艦隊中的分裂者作戰，最終，強烈的懷疑情緒與認知危害嚴重影響了艦隊指揮層，分艦隊之間甚至開始相互交火，混亂的局面一直到薛林佛人內戰13結束併產生了對太陽系政府友善的政權後才緩解，太陽系政府得以直接介入並掌控黑域內的局勢。

關於黑域分裂危機是否代表著太陽系政府成立後，Scp基金會的分裂，有著很多爭議，但後世大多數官方單位，尤其以基金會主義為主的多個主要政權，皆不認定黑域分裂危機是一次正式分裂，Scp基金會在解散前仍始終保持為一個整體。

伴隨太陽系政府的直接介入，黑域遠征有了重大進展，成功定位了地球所在的theta-c星系，並發現了被轉移到黑域中的倖存公民群體，也就是地球聯合艦隊14，這是一個以類似流浪政府的遊牧模式執行、被承認合法的星區政府，創始公民一共4413名人類、56名卡拉恩叢族與約莫1300名其他太陽系種族公民，其總人口已達到五億到六億間浮動，是黑域範圍內規模最大的本地勢力，並且發展出獨特的文化與軍事體系，由於其特殊性，地球聯合艦隊的公民又被稱之為暗星族，其文化圈與社會生活圈被以黑域命名。

地球聯合艦隊的政府結構雖然仍以太陽系中央政府為模板設計，但實際運作上與泡沫社會中的其他地方政府有極大不同，且擁有獨立的沿革史，主要以theta-c超新星爆炸事件以及迴歸太陽系政府為分界，分為殖民時代、漂流時代以及自治時代，建立之初的殖民時代，由於生產能力與技術能力缺失，其治下的殖民地功能大多僅限於小規模資源採集與糧食生產，社會主體依存於一個名義上為聯邦，但實質上接近邦聯形式運作的政府，轄區涵蓋新露娜星的密涅瓦基地與theta-c星系內多顆資源星球，一支龐大的遊牧艦隊穿梭其間以保持聯絡與流動性，該政府曾自力建造一艘方舟級機動空間站，即為巨石號，自啟用便一直作為黑域社會的政治中心與歷史象徵。

較獨特的一點是Scp基金會這一獨特的艦隊政府中在其中並不佔有主導權，缺少強大的基金會艦隊形成武力壟斷，各GoI間的實力差距不大，為了平衡各大組織的話語權與內部和平，地球聯合艦隊採取了實質民選的半總統制，其臨時憲法要求在遵循三原則的前提下，將軍政法與民生法的界線虛化，強調所有所屬公民的命運共同性，以及全民皆兵的義務性，軍隊名義上由民主程式選出的政府首腦為統帥，但不再以基金會艦隊自居，而是各自以出身的派系命名，Scp基金會稱為基金會空間部隊，自視為基金會艦隊的正統傳承，擁有唯一僅存的超光速引擎飛船與AIc管理系統；蛇之手成立赤鏈蛇航太作戰聯隊，提供太空中的超自然戰鬥手段，很長時間都是艦隊中反對基金會派系執政黨的主要在野勢力；安德森公司成立全自動太空安保部隊，是早期解決人力短缺問題的重要組織；卡拉恩叢族建立的索恩運輸船聯盟則成立武裝運輸團，因其蟲口數量增長快速，其在民選政府中擁有極大話語權；由掌握電子超科技的多個較小GoI合組的閃電火部隊，主責於應對黑域社會中的電子犯罪以維持資料層治安，此五支部隊組織了獨立於民選政府的五軍理事會，功能性類似於N.E.A.c協調會議，負責協調忠誠於不同組織的武裝力量，是地球聯合艦隊的主要武裝力量，也被認為是各大組織為隨時