由一名行政長官領導。同中央政府一樣，地方所有官吏都由政府委派，其中大部分省長由拿破崙直接任命。這些省長直接向中央政府負責。他們職權的專業化，提高了管理水平和辦事效率。

拿破崙認為強大的國家必須擁有強大的工業和發達的商業。政府給工業以鉅額津貼，建立新企業，舉辦工業博覽會，鼓勵機平生產。1800年2月13日，在〃往來存款銀行〃和“商業貼現銀行〃的基礎上建立了法蘭西銀行。此銀行在法國金融和工業生活中起了重要作用。為了保護國內工商業發展，拿破崙政府採取了堅決的關稅保護政策，抵制國外商品在國內市場的傾銷。在交通運輸方面，1800年，政府投資修建從巴黎到里爾、馬賽、波爾多、斯特拉斯堡和布勒斯特的各條公路，並著手開拓聖康坦、烏爾克等運河。拿破崙派遣了很多工程師到工地，自己也經常去那裡，同工程師們一道擬訂開拓方案。這一切加速了法國資本主義的發展。

身為第一執政的拿破崙這時更加認識到人心向背對一個政權鞏固的重要性。為了籠絡人心，他在盧森堡宮向榮立戰功的官兵授予榮譽馬刀和步槍。在第一批被授予馬刀的官兵中，有一個叫萊翁。奧納的擲彈兵軍士，他獲准上書第一執政表示謝意，拿破崙立即覆通道：“我收到了你的信，我勇敢的同志；你無須提醒我你的英勇行為；自從勇敢的班納賽特死後，你是軍中最勇敢的擲彈兵。你領取了我分授的100把馬刀中的一把，誰都同意，你是最當之無愧。我很想再見到你，陸軍部長下令讓你前來巴黎。〃這封信在全軍流傳，法國最偉大的將軍、第一執政稱呼一個軍士為他的勇敢的同志，這種平等的態度使整個軍隊熱情高漲。

拿破崙這種籠絡人心的手段同樣也運用在文官中。拿破崙素以精力旺盛、不知疲倦而著稱，他每天除了幾個小時睡眠、15分鐘的午餐和不到15分鐘的早餐時間外，其餘時間全部都用來工作。他也以這個標準去要求別人。在他身邊的每個人不得不超出一切限度來工作，然而，沒有人對此抱怨。一個曾在拿破崙時期長期任職的官員說：“拿破崙有一種用親暱而毫不拘禮的態度來提高人們對事業的忠誠的本事。他在必要的場合下，善於用這種態度來對待下級，像對待平級的人一樣。〃這種本事使人們產生激情，就像他在軍隊裡使官兵產生激情一樣。人們在工作中累得精疲力盡，就像官兵們在戰場上犧牲一樣，毫無怨言。文官們也像武官們一樣，為了得到一枚勳章或主宰的一個微笑，而不惜赴湯蹈火。

大權獨攬的拿破崙也有因意氣用事而作出錯誤決定的時候，但性格倔強的拿破崙什麼時候也不走回頭路，即使明知是一個不公正的決定，他也不會立即去改正它。在他初為執政時就發生過這樣一件事。

1799年春拿破崙在埃及時，督政府曾把曼圖亞城防司令一職授予拉圖爾。弗阿薩將軍。拉圖爾擔任這一重要職務不久，奧軍便來圍攻曼圖亞。7月間，拉圖爾將軍向奧軍投降，曼圖亞失守。督政府懷疑拉圖爾將軍暗通奧軍，便下令軍事法庭調查這位將軍的行徑。

拉圖爾回到法國後，立即為失守曼圖亞辯解。拿破崙升任執政後，聽說這一案件，氣憤異常。曼圖亞是他蒙受了巨大犧牲才拿下的，如今卻失守在這位將軍的手裡，不能不心痛。他不等拉圖爾的罪責得到證明，便停止了軍事法庭的調查，宣佈拉圖爾有罪，併發布了一道針對他的激烈法令。這一專斷的決定引起了眾多將領的不滿�