第二次退位6月21日，拿破崙回到了巴黎。這時兩院已經背叛了皇帝，他們宣佈國家處於危險中，拿破崙必須退位方能保證國家的安全與和平。可在工人區，人們卻在大聲疾呼：堅決反對皇帝退位，堅決保衛巴黎。6月21日和22日兩整天，不斷有遊行隊伍高呼：“皇帝萬歲！打倒叛變者！擁護皇帝或者死亡！不需要退位！要皇帝和國防！打倒議會！〃憤怒的人群在街上把一些衣著華麗的、被他們懷疑為貴族的人打得半死，因為他們拒絕和群眾一起喊：”不需要退位！〃拿破崙的弟弟呂西安極力建議他像當年霧月18日那樣解散兩院，重新徵召軍隊，準備再戰。共和派卡爾諾也要求拿破崙實行專政和發動人民戰爭以應付危急局面。可拿破崙認為時代不同了，他所依賴的資產階級完全拋棄了他，他不願意把平民大眾與資產階級對立起來，不希望看到自己的國家發生內戰，於是，他屈從了議會的決議。6月2　2日，他再次簽署了退位詔令，內容如下：“法蘭西人！在這場維護國家獨立的戰爭開始時，我曾指望一切努力、全部意志和國家所有的官廳聯合一致。我以希望這種聯合的成功為根據，藐視了同我敵對的列強所發出的一切公告。形勢出現了變化。我面對法國敵人的憎恨，自行作出犧牲。但願像他們在宣告中所說的，他們確實是真誠的，即僅僅仇視我個人！我的政治生命已經完結了，我宣佈：我的兒子以拿破崙二世的稱號為法蘭西人的皇帝。現任的各位大臣將暫時組成一個政府會議。我對於我的兒子的關心，促使我請國會迅速依法建立攝政制。為國家的安全，為保持民族的獨立而聯合起來。”

兩院接到拿破崙的退位詔令後，為了對遜皇保持應有的敬意，派了一個委員會前去答謝拿破崙。拿破崙最後一次身穿皇袍，接見了前來致謝的委員會，各位國民大臣隨侍在側。他看上去蒼白而悽慘，然而堅定而能自制。他在答詞中建議舉國一致迅速準備防務，他還提醒大家他的退位是有條件的，包括他兒子的利益在內。下院議長懷著誠摯的敬意答道，他剛才所提的各個問題，下院沒給他任何指示。這時拿破崙已看清，他兒子繼位是沒有希望了。他尊嚴而有禮貌地送走了這個委員會。拿破崙再度登位時期——百日政權到此告終。

拿破崙下臺之後，富歇任首席執政，組成了臨時政府。聯軍漸迫巴黎，拿破崙屢次寫信給富歇，表示願意指揮士兵防衛巴黎，可得到的回答是請他趕快離開巴黎前往羅什福爾港，那裡備有兩艘巡洋艦運載他去美國。

拿破崙毫無怨言又不失尊嚴地順從了他的命運。6月29日，拿破崙離開馬爾梅松。7月3日抵達羅什福爾港。臨時政府請求惠靈頓發給拿破崙赴美護照，但惠靈頓因未得到本國政府的訓令而拒絕發給。

現在臨時政府又試影象1794年那樣喚起士兵的抗戰熱情，但未能成功，士兵們拒絕打仗，〃因為他們沒有了皇帝。“這時，蘇爾特和格魯希的殘軍被趕到巴黎城下，英軍和普軍緊追其後。經過一陣毫無作用的抵抗之後，法軍總司令達武於7月3日與聯軍締結了休戰協定，首都向聯軍投降，法國軍隊撤往盧瓦河以南。聯盟各國隨即通知臨時政府，他們的職權已告結束，路易十八數日內即將重掌王權。臨時政府自行解散。7月8日，大腹便便的路易十八再次住進了他祖先的王宮。

由於英國艦隊嚴密地封鎖了通往大洋的一切出口，拿破崙只得停留在羅什福爾港。這裡的人們得知皇帝來了，從四面八方聚集到拿破崙的住處，高呼〃皇帝萬歲！〃這時有人向拿破崙建議，不要坐巡洋艦，而是坐上一隻小船秘密地開出海去，可拿破崙不希望那樣做。7月8日，拿破崙登上一艘巡洋艦，來到羅什福爾城西北的一個叫埃克斯的大島上。島上的人們立刻認出了他，水兵、士兵、漁夫、居民從不同方向湧向巡洋艦，希望能看一眼皇帝。