朝的勢力可以和他的大中朝相抗衡了。

他這段時間一直很好奇，在他覆滅了大明王朝之後，還會不會出現南明政權，這段時間他雖然在北方處理各種事物，但是卻一直也在關注著南方的局勢發展，並且令留守南京李進德和付德明等人，不斷的派出能言善辯的使臣，南下到南方諸省去規勸那些南方諸省的明朝官員投降大中朝。

從前段時間初步反饋回來的訊息來看，自從南方得知了崇禎皇帝已經自縊身亡的訊息之後，便已經是徹底亂了手腳，再加上後來又聽聞說太子朱慈烺和二位皇子都落在了大中軍手中，而且朱慈烺還在肖天健的“脅迫”之下，以大明太子的身份在北京城宣佈了大明王朝就此終結，並且禪位給肖天健，讓肖天健執掌天下！更可氣的是三位皇子和兩個公主殿下居然還認賊作父，成了肖天健的義子義女。

於是南方諸省的明朝官員們頓時哀聲一片，不少地方的明朝官吏，當即便同意了前往勸降的大中朝使臣的要求，宣佈接受大中朝的統治，舉城投降大中朝。

短時間之內江西全境在一個多月的時間，便基本上全部投降了大中朝，而坐鎮南京的諸部也以最快的速度，派出了接收大員前往了江西各地接受投降，留鎮南直隸的石冉也立即派兵南下，接防了江西的防務，並且接受了當地的明軍的投降，對這些明軍進行了整編。

八月之中，浙江南部各地也紛紛宣佈投降大中朝，並且迅速的被南京各部和大中軍接了過來，進而臨近四川和湖廣的貴州巡撫，也宣佈了投降大中朝，按照事先的劃分，羅汝才立即率兵進入了貴州，接受了貴州的投降，同樣南京各部也馬上朝貴州派出了接收大員。

肖天健本來以為如此下去，應該很快便可以解決南方諸省的問題，形勢可以說是一片大好，只等兩廣、雲南、福建四省也宣佈投降，下一步再解決了李自成之後，他便可以一統天下，騰出精力來一邊恢復國內的經濟，一邊籌集兵馬北上，全力解決建奴這個大麻煩了。

可是讓肖天健沒有想到的是在這個時候，南方還是出了麻煩，使得肖天健也顧不得陝西的和李自成的決戰了，授命閻重喜和劉寶全權負責清剿李自成大順軍之事，並將手頭北方的事務暫時交代給了盧象升和羅立等人之後，便立即開始南下，趕往了南京。

肖天健之所以忽然間放下清剿李自成之事飛速南下，其實原因很簡單，就是八月間，南方諸省在得知京師被大中軍所克，大明崇禎皇帝已經殉難，而且皇太子朱慈烺宣佈禪位給肖天健，宣告從今以後再不謀登臨天下，同時也宣告了大明王朝終亡。

南方諸省官府以及官軍聞之立即大亂了起來，臨近大中軍控制區的江西、貴州、浙江等省隨即便放棄了繼續跟大中朝為敵，朝南京遞降表宣佈投降大中朝。

本來肖天健以為，南方的事情應該可以相對比較容易解決了，歷史上的南明朝廷很可能不會再出現了，可是讓肖天健沒有料到的是最終事情並沒有像他預料的那樣發展。

福建、廣東、廣西以及雲南四省卻並未像他想象的那樣輕易就放棄了抵抗，歸服於大中朝的統治，相反在經過最初的慌亂之後，南方還是在明朝舊吏們的推舉之下搞出了南明朝廷，以朱家皇室子嗣繼承大明王朝的衣缽，宣佈要繼續和大中朝對抗下去。

不過讓肖天健萬沒有想到的是，與歷史上大為不同的是南方這一次居然同時出現了兩個皇帝。

隨著臨時在南京主持政務的付德明和李進德的一封奏疏，肖天健這才在北京得知，先是廣西巡撫翟式耜以及大學士丁魁楚以及兩廣總督朱治澗等人，在廣東肇慶府擁立明神宗之孫朱由榔稱帝，改元永曆，宣稱繼承大明王朝，要行復明之舉。

可笑的是就在朱由榔在肇慶府稱帝的同時，福建巡撫張肯唐以及福建總兵鄭芝龍卻