1625年，朱由校下詔為信王挑選王妃，次年開始在北京城為其興建信王府。朱由校在位期間，一心沉迷玩樂，無心朝政，致使朝中大權落在宦官魏忠賢手中。魏忠賢在擊敗東林黨派後，一人獨大，權勢滔天，整個大明王朝被其搞得烏煙瘴氣，如同陷入了無盡的黑暗之中。

此時的朱由檢作為藩王，對於宦官弄權的弊端都看在眼裡，但他並沒有表現出來，而是韜光養晦，暗中記下魏忠賢的每一筆賬。

時間來到公元1627年，這一年朱由校病入膏肓，由於膝下並無子嗣，便緊急召集信王朱由檢入宮，將皇位傳於他。很快，朱由校駕崩於乾清宮，年僅23歲，在位僅七年。

同年，17歲的朱由檢奉詔繼承皇位，是為明思宗，改年號為崇禎。明思宗朱由檢上位後的第一件事，就是剷除魏忠賢，意圖實現撥亂反正。然而，此舉卻打破了朝堂上的政治平衡，使得原本被壓制的文官集團迅速崛起，並最終獲得了獨大的地位。

在公元1628年的時候，明思宗朱由檢為了能夠抵禦外敵的入侵，重新啟用了袁崇煥作為兵部尚書，並將收復全遼的重任託付給了他。而就在同一年，陝西長城遭受了一場嚴重的旱災，這使得當地百姓生活困苦不堪。在這種艱難的情況下，王二挺身而出，帶領著眾多農民發起了起義。他們勇敢地殺死了知縣，並笑著隱居到山林之中，由此正式揭開了明末農民戰爭的序幕。

到了1629年，明思宗朱由檢又任命楊賀擔任陝西三邊總督，專門負責處理陝西地區的民變問題。同時，他還要求楊賀採取以撫為主、以剿為輔的方針來處理此事。在短期內，這個策略確實取得了顯著的成效，許多起義者紛紛接受招安，局勢得到了一定程度的緩解。

然而，在同年的十一月，袁崇煥成功擊退了後金軍隊，但不幸的是，魏忠賢的餘黨趁機上奏彈劾袁崇煥與敵人勾結。與此同時，皇太極也巧妙地利用了反間計，使得明思宗朱由檢對袁崇煥產生了懷疑。最終，明思宗朱由檢在聽信了這些謠言之後，果斷地下令逮捕袁崇煥入獄。隨後，在第二年，袁崇煥被處以極刑——凌遲處死。

公元1631年，由於當時根本的社會矛盾並沒有得到解決，之前那些被招安的人也沒有得到有效的安置，於是他們就再次發動了起義。明思宗朱由檢得知這個訊息後非常憤怒，立刻下令讓洪承疇擔任陝西三邊總督，並要求陝西督府積極採取措施平定叛亂。

同年十一月，皇太極率領後金軍成功攻陷了大淩河城。而孔有德和耿仲明在支援大淩河城時竟然叛變投降，直接投奔了皇太極。這使得後金軍隊得以順利攻陷旅順，並且將明朝紅衣大炮的先進技術傳到了後金。從此以後，明軍在作戰中面臨著更大的壓力。

到了1636年，在洪承疇、盧相生和孫傳庭三人的通力合作下，起義軍遭受重創，連連敗退。最終，他們成功擒獲了高迎祥。然而，起義軍並沒有就此罷休，他們推舉李自成為新的“闖王”，再次起兵反抗明朝。

就在同一年的四月，皇太極正式稱帝，建立了滿清政權。緊接著，他派遣軍隊大規模侵略京西地區，這次事件被稱為“明子之變”。

10月13日，明思宗朱由檢決定啟用楊嗣昌為兵部尚書，期望這位經驗豐富、富有才華的官員能幫助國家擺脫困境。不久之後，朱由檢更是將楊嗣昌提拔為禮部尚書兼東閣大學士，賦予他更大的權力和責任。

1638年，楊嗣昌提出了四六正與十面網的戰略，並取得了顯著的成果。絕大部分起義軍被剿滅，李自成也被迫率領著僅剩的18騎逃竄。然而就在此時，皇太極第五次發兵入侵，導致荊棘告急，史稱“戊寅之變”。面對如此危機，朱由檢緊急調動洪承疇、孫傳廷等將領前往秦王，但他們對於清軍的攻擊卻無