隸總督兼北洋大臣李鴻章入京，任命他為全權代表赴日議和。李鴻章入京以後，慈禧太后又稱病不出，讓光緒皇帝負責接見。

在1895年2月22日的朝會中，光緒帝讓李鴻章與眾臣議論媾和之事，李鴻章堅決反對割地，翁同龢主張倘若可以迴避割地，即便鉅額戰費賠償，也可以忍辱負重。大臣孫毓汶、徐用儀認為當前形勢急迫，若迴避日，割地條件，和平交涉將無法繼續。文廷式還主張效仿俄國沙皇亞歷山大一世遷都最終戰勝拿破崙的故事，要求遷都再戰，但很快被否決。李鴻章聲稱：“割地則不行，議不成則歸耳！”其後李鴻章又拜會各國公使，乞求干涉，但均無結果。李鴻章見割地已成定局，便於3月2日就割地一事上奏皇帝，要求“面諭訓誨”，非要從光緒帝口中得到明確的割地的授權不可。光緒帝無奈，只好表示可以授予李鴻章“以商讓土地之權”。於是在1895年3月13日，李鴻章以頭等全權大臣的名義，帶著每，前任國務卿科士達為顧問，率100多名隨員前往東洋人馬關（今下關），與東洋人首相伊藤博文、外務大臣陸奧宗光進行談判。1895年3月19日，李鴻章抵達東洋人馬關，住在接引寺（古代為朝鮮通訊使的住所）。3月20日雙方在春帆樓（下關有名的東洋人料理旅館，以烹調河豚聞名）會見，正式開啟了和談。

中方參加談判的有：頭等全權大臣李鴻章、參議官李經芳（李鴻章養子）、參贊官羅豐祿、參贊官伍廷芳、參贊官馬建忠、參贊官盧永銘、參贊官羅庚齡為翻譯官。

日方參加談判的有：全權辦理大臣伊藤博文、全權辦理大臣陸奧宗光、內閣書記官長伊東巳代治、外務書記官井上勝之助、外務大臣秘書官中田敬義、外務省翻譯官陸奧廣吉、外務省翻譯官楢原陳政。

從1895年3月21日到24日清政府與日，雙方進行了前三輪談判。當時北洋水師雖全軍覆滅，但是遼東戰場爭戰方酣，而且日　軍在談判前的3月16日成立了所謂“徵清大都督府”，以參謀總長小松彰仁親王為大都督，準備進駐旅順，直搗北平。

指揮“直隸平原作戰”。

所以李鴻章要求議和之前先行停戰，日方提出包括佔領天津等地在內的四項苛刻條件，迫使李鴻章暫時撤回停戰要求。李鴻章遂問及條款，日方決定在下一輪談判中出示條款。

伊藤博文在第三輪談判中透露割讓臺灣島之事，李鴻章答以英國將會干涉，伊藤微笑說：“豈止臺灣而已！不論貴國版圖內之何地，我倘欲割取之，何國能出面拒絕？”總之，在前三輪談判中，伊藤博文對李鴻章極盡羞辱之能事，而李鴻章則委曲求全，惟恐和議中梗。日方以酷苛的條件使清政府方面自動撤回了停戰的提議，達成了不停戰而和談的目的。

後期談判

3月24日第三輪談判後，李鴻章回接引寺住所的途中突然遭倭寇人小山豐太郎槍擊，造成李鴻章左眼下受傷。此次意外事件的發生使東洋人的談判優勢銳減，令倭政府極為狼狽，氣急敗壞，承認“由於此次兇變，帝國不得不立於甚為困難之地位，反之，清國卻因此對各國得到最好的口實，清政府使者或將立即歸國。

而當其向各國哀訴時，各國將向彼表示同情，且難保不轉而以其聯合之壓力抑制我方”。倭擔心造成第三國干涉的藉口，一方面由天皇、皇后親遣醫生和護士對李鴻章進行治療並給予慰問，另一方面自動宣佈承諾休戰。

李鴻章也沒有像東洋人所擔心的那樣立即歸國，而是繼續談判。3月30日，雙方簽訂休戰條約，休戰期21天，休戰範圍限於奉天、直隸、山東各地。

此時東洋鬼子已於3月23日襲佔澎湖，造成威脅臺灣之勢，停戰把這個地區除外，保持了倭在這裡的軍事壓力。

這一風波平息後，