原種繼支援下，於五年前遷都山背國的長岡，離開了貴族和大寺院等守舊勢力盤根錯節的大阪。

守舊勢力企圖加以阻止，將倡議遷都者藤原種繼殺害，但是大伴氏、佐伯氏、丹治比氏等陰謀分子旋即受到嚴懲，同年天皇下聖旨宣佈遷都平安京，這一事件史稱“平安京遷都”。

桓武天皇在位期間積極維護法制，重新整理新地方政治。恆武六年制定國郡司考績條例16條，用以考核地方官吏政績，打擊貪官汙吏。

恆武八年新設勘解由使，責成其嚴格監督新任國司與前任的交接事宜，起到整飾地方官紀的作用。另外任用有才能者為郡司，突破譜第禁區，還大力裁減編外國司郡司。

社會經濟制度方面也進行了改革。桓武天皇鑑於班田收授制度在其實施上存在著一系列問題，乃將班授時間從6年一班改為12年一班，他還實行貸稻（出舉稻）制和改革良賤制度，將出舉稻的利率從50%降至30%；公元789年承認良賤之間通婚為合法，所生子女為“良民”。良賤制度修改是從法律上徹底取消奴隸制度的一個重要步驟。

在軍制方面，由於公地公民制在瓦解，公民兵制已行不通，恆武十年桓武天皇乃廢除邊境以外各地的徵兵制，而代之以從郡司子弟和富裕者中招募的“健兒制”。桓武朝改革使農民的債務負擔和徭役負擔相對地有所減輕，奴婢逐步得到解放，這應視為班田農民和奴隸長期以來進行各種形式鬥爭的另一成果。

可是這種改革觸動了幕府，大名和貴族的利益，他們聯合起來抵制天皇，併發兵討伐，雖然最後天皇獲得了勝利，可也向世人展示了天皇也不是不可以撼動。

從此以後，各地幕府將軍和大名都聽調不聽宣，並且相互之間互相征伐，經過十幾年亂戰，現在東瀛島的局勢成穩了。

德川幕府控制著平安京，廣島，長崎，三郡

天皇被德川幕府控制，住在平安京，天皇已經名存實亡，政令都出不了他的皇宮，更別說出平安京了。

鎌倉幕府控制了大阪，北海道，福岡三郡

室町幕府名古屋，橫濱，兩郡

江戶幕府控制了神奈川，崗山兩郡

東瀛曾經盛極一時的櫻花帝國結束了，徹底進入了幕府時代，各個幕府之間相互征伐，人腦子都打成狗腦子了。