。拿破崙聽到這一訊息後，馬上帶領部分近衛軍疾馳趕來增援，穩住了防禦陣地。然而，法軍終歸寡不敵眾，逐漸被聯軍擠壓到萊比錫城裡及其近郊，內伊和另一名軍長也負了傷。

傍晚時分，拿破崙坐在郊外的營帳中，向貝爾蒂埃口述著作戰命令。就在這時，兩名炮兵指揮官前來報告：炮彈快打完了。拿破崙臉色蒼白，意識到大勢已去，指示貝爾蒂埃向部隊下達撤退命令。貝爾蒂埃立即照辦了。也許是過分疲勞，拿破崙下達完命令後，竟躺在板凳上睡著了。將領們站在他的周圍，默默地望著他，周圍一漆黑暗。最後戰鬥的呼喊聲、傷員的呻吟聲和軍隊撤退的車輪聲混雜在一起，不斷地傳入拿破崙的營帳。一刻鐘以後，他突然醒來，立即趕往萊比錫城內。

10月19日，法軍從各個方向撤下來，都匯合到萊比錫城內，向西面唯一的出口林德瑙大橋退去。每條街都擠滿了密密麻麻的撤退部隊。這時，普軍和瑞典軍正突入北郊，奧軍也從南面逼近城裡。彈藥車、馬隊、炮兵、牛羊、傷兵和隨軍小販等等，都擁擠在一起，爭相逃命。敵軍每一發炮彈落下來，都可以聽到許多受傷人的呼號聲。拿破崙在經受一連串的打擊後，仍然保持著一貫的冷靜，他在少數侍從的陪伴下，若無其事地和混亂的人流一起渡過了林德瑙橋，彷彿周圍的毀滅景象與他毫無關係。過橋後，他在林德瑙附近的一個磨房裡平靜地入睡了。他要等待法軍全部過河，然後再繼續隨軍西撤。

19日上午9時，沙皇要求堅守萊比錫的法軍後衛部隊投降，以保全該城，但遭到守城法軍的斷然拒絕。

就在拿破崙熟睡之際，突然從遠處傳來了巨大的爆炸聲，拿破崙驚醒了。過了一會，繆拉跑進來報告，林德瑙橋被炸燬，麥克唐納所率的後衛部隊2萬多人被阻隔在河對岸。拿破崙聽完，雙手緊緊抓住腦袋，大聲吼道：“這也算執行我的命令？〃原來，拿破崙曾命令守橋者，只要敵方追兵已到，就立即炸燬橋樑。當布呂歇爾的少數騎兵沿河向林德瑙方向迂迴時，槍聲使守橋工兵著了慌，他們誤以為敵人的大隊追兵已到，趕緊引爆了預先放置好的炸藥，炸燬了法軍撤退的唯一一座石橋，結果，後衛2萬多官兵無法過河。這時，後面的敵軍已緊緊追來，法軍無路可逃，只得跳入波濤滾滾的大河之中。麥克唐納僥倖游到了河岸，其餘的均葬身魚腹。波尼亞托夫斯基軍長，這位前兩天才被提升為元帥的波蘭親王，也被浪濤吞沒了。沒來得及跳河的官兵，包括勞里斯頓、雷尼埃兩位軍長在內，還有260門大炮、870輛彈藥車全都被聯軍俘獲。

拿破崙率殘軍繼續退卻，聯軍未作積極追擊。10月20日，在魏森費爾斯渡過薩勒河。23日，進入愛爾福特。在這裡，拿破崙接受了繆拉的辭行。繆拉回那不勒斯去了。這時法軍還剩下12萬餘人。30日，法軍快接近法蘭克福時，4萬名巴伐利亞軍擋住了拿破崙的退路。敗退中的法軍仍不示弱，集中了50門大炮朝敵人猛攻，巴伐利亞軍大敗而逃。

法軍透過法蘭克福西撤。11月2日，到美因茲。停留7日後，撤往巴黎。在這之前，聖西爾軍在德累斯頓已成孤軍，被迫投降。法軍在維斯瓦河、奧得河、易北河一帶的要塞全部丟失。

法蘭西戰役萊比錫戰役後，拿破崙第一次意識到他的大帝國已處在岌岌可危的境地。他的哥哥、西班牙國王約瑟夫已被英國人和西班牙起義者趕出了伊比利亞半島；他的弟弟、威斯特法利亞國王熱羅姆也從卡塞爾出走；達武在漢堡被俄軍和普魯士軍圍困；法軍在荷蘭的權力也在開始動搖。更讓拿破崙痛心的是他的親妹夫、那不勒斯國王繆拉也開始背叛了他。當歐仁將這一訊息告訴他時，他拒不相信，他向左右的人嚷道：“不，這不可能。繆拉，我把妹妹嫁給了他，我把王位賜給了他，他不可能宣佈反對我。