乾隆五十七年(1792年),進軍西藏,擊退廓爾喀入侵,越過喜馬拉雅山,兵臨陽布(今尼泊爾加德滿都),迫使廓爾喀稱臣請降,許諾永不侵犯藏境,後授武英殿大學士,累封一等嘉勇忠銳公。
乾隆六十年(1795年),鎮壓湘黔苗民起義,翌年封貝子,不久即病逝軍中,追封嘉勇郡王,諡號文襄,配享太廟,入祀昭忠祠與賢良祠。
可以說,福康安參與或指揮了乾隆中後期的幾次重大戰役,功勳卓著。
在政治上,福康安整頓雲南銅政,他懲貪擢賢,迅速淨化了雲南銅廠生產鏈條,調整了考核辦法,另覓新廠,使得雲南銅產量迅速恢復並超過清廷定額。
至此,雲南銅廠生產,在乾隆後期至嘉道之時,都能得到較好的維持。
並且,福康安處理了臺灣善後事宜,他在初步領軍鎮壓林爽文起義後,建議清廷頒佈《清查臺灣積弊酌籌善後事宜》章程十六條,以嚴明臺灣吏治,加強管理。
從此,清廷對臺灣的統治進入了一個新的階段。