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而率領清兵向商家軍發動最後攻擊的屯齊，在戰到最後，本打算自殺殉國，但被商家軍計程車兵一擁而上，打掉了用來自殺了佩刀，結果被商家軍生擒活捉，成了俘虜。

商毅是在十六日清晨進入南京，這時皇城裡的戰鬥己經基本結束了，士兵們正在清理皇城裡的戰場，撲滅燃燒的火焰，並且收容降兵和俘虜等等工作。不過在皇城外面，零星區域性的戰鬥還在進行著，因為南京城實在是太大了，而且這時人口稀少，讓清軍有足夠的空間躲藏，同時還有一部份清兵逃出了南京，在城外流竄，也給商家軍的清尾工作帶來了一些困難。等到全面肅清南京城裡的清兵，己經是三天以後的事情了。

但這一切都不足以改變大局，整個南京地區這時也都已經被商家軍全面收復。而這時距離商毅從南京撤離的時間，己經過去了十個月。

這次進攻南京的戰鬥一共進行了五天，商家軍一共戰死了二萬四千一百七十三人，傷一萬三千六百二十二人，而殲滅清兵四萬一千三百八十八人，俘虜竟多達四萬八千四百一十七人，這還不算被清軍臨時徵調來的民兵。

這些民兵還剩餘三萬多人，經過鑑別之後，全部都釋放了。其實鑑別起來也非常容易，只要是說得一口流利的南京話，基本就能夠證明是被清軍臨時徵調來的南京人，也可以被釋放。當然也有一些不會說南京話，但也自稱是民兵的，只能先關押起來，以後慢慢分辯。

另外在戰鬥結來之後，還繳獲了清軍的戰馬七千餘匹，各種火炮二百二十七門，火銃六千三百七十七杆，盔甲刀槍旗幟更是不竍其數，還有糧食十萬餘石，白銀六十萬餘兩等等其他物資。因為清軍並洠в欣吹眉鞍閹�形鎰識莢俗摺Ｖ皇潛磺寰��駁拿鞽�僭保�謔業熱碩急蛔�票鄙稀�

商毅和亞莉桑徳拉一行人馬是在成進的陪同下，跨乘著騎在高頭大馬，沐浴著清晨的陽光，以勝利者的姿態，從承天門直接進了南京的皇宮。沿途計程車兵看到商毅的一行人，也都紛紛停下來，向商毅行禮，還喊著：“督師”或是“商督師”。而商毅在大馬上，也向他們一一還禮，也道：“大家辛苦了。”

穿過了承天門之後，商毅騎在高頭大馬上，左右看著南京的皇城建築，雖然這不是商毅第一次進南京的皇宮，但這一次的感覺和以前那一次都不一樣，因為這個時代的南北二都之一的南京，如今己經完全在自己的掌握之中了。因此心裡也充滿了自豪感。

亞莉桑徳拉和商毅一起進過北京的皇宮，但南京皇宮卻還是第一次來，因此在馬上也是左顧右盼，雖然戰爭留下的痕跡仍然十分明顯，有部份建築甚致都己經被燒燬，但依然掩飾不住皇城的優觀華麗和威嚴氣氛。

透過了午門，也正式進入了南京紫禁城，可以看見在正前方屹立的太和殿，亞莉桑德拉也不禁嘆息道：“商，我還以為北京的皇宮己經是這個世界上獨一無二的了，但南京皇宮看起來，似乎一點也不比北京的皇宮差。這樣壯觀的皇宮有一個就已經是奇蹟了，在你們的國家裡居然有兩座，簡直是太不可思議了。”

商毅呵呵一笑，正要說話，這時在太和殿前忙著清理戰場計程車兵也都紛紛停了下來，擁到商毅一行人的進前，縱聲歡呼，有的喊著“督師威武”也有人喊“督師萬勝”。而商毅也努力模仿著在影視劇看到天朝太祖的光粹形像，在馬上向兩側計程車兵們揮手致意。

就在這時，也不知誰大聲喊了一句：“督師萬歲。”

人群中都稍停了一下，但馬上就有人附合起來，跟著大喊“督師萬歲”“督師萬歲”。隨後，其他人也都加入了歡呼聲中，不多時整個皇宮裡都形成了一個統一的聲音，全部都是“督師萬歲”。