於佛教僧侶很好的宗教政策，後赤松德贊讓佛教與本教進行公開辯經，以決勝負，在辯論結束後，赤松德贊宣佈佛教獲得勝利（本教則對辯經的勝負結果持相反的看法，也有的認為勝負未分），本教徒們連同他們所在的寺院一起被迫改宗印度佛教，本教寺院的佛像被隱藏入地下。凡不願意改宗的本教僧人被流放到阿里、安多和康區等邊遠地區，繼續信仰和傳播他們的宗教。這次使本教與公元7世紀始傳吐蕃的印度佛教之間兩百多年的鬥爭見了分曉，最終以佛教的勝利而告終。

佛教被松贊干布引入吐蕃，當時的印度佛教僅僅是一個侷限在吐蕃王室傳播的外來宗教，還無法撼動本教的地位；到了赤松德贊統治時期，佛教和藏語文一起作為一個強勢的文化在吐蕃王室的大力扶持下，迅速佔領了吐蕃宗教文化的主導地位。到了後弘期經歷朗達瑪滅佛事件以後，佛教從安多地區逐漸開始重新傳播，並且逐漸在民間得勢，在很短的幾個世紀裡，佛教遍及整個吐蕃。而本教在赤松德贊以後一直處於劣勢，尤其在作為政治文化中心的衛藏地區，基本上被清除逸盡。

至於到了如今，關於本教的現狀。

本教是藏民族的本土宗教，它的影響不可能隨著教派的衰落而消失。直到今天，本教仍然深刻地影響著藏民族精神和文化生活的某些方面。另外，本教的儀軌、修法、密宗、大圓滿等傳統都有其獨特的傳承體系，這對於我們研究藏傳文化是極其重要的。本教《甘珠爾》就記載了本教這個**本土宗教的教義、儀軌及其產生和發展的歷史軌跡。

經過上千年的磨合，本教與藏傳佛教之間在一些重要教義上的融合縮短了這兩個宗教之間的距離，消除了兩者之間的許多分歧，促成了這兩個宗教傳統在許多重要教義上的共識，使他們之間的關係也不斷融洽。值得一提的方面：夏扎仁波切（1858~1934），法號扎西堅贊（譯為吉祥勝利幢），在大圓滿方面的修行、研究和著作。夏扎巴一生修習大圓滿，是一個虹化了的本教舊派（古本）大圓滿成就者，在夏扎巴三十歲前後，他在四川康區與蔣貢康楚、蔣揚欽哲確吉羅卓、秋吉林巴、米龐蔣揚嘉措等人發起了稱之為“利美”的無教派運動併成為其中本教的代表，也使他明確的瞭解了佛教各派系的修法，由於他不需修持各派教授而一見之下就能自然通達，由此獲得了很大的聲譽，據說當時藏傳佛教的五大派都有拜訪求學於他或探討學習的。夏扎巴的著作彙整合冊的有十八部，其中最重要的有五部：《法界明智藏寶庫》（dbyingsrigmdzod）、《教理藏寶庫》（lugsrigsmdzod）、《經藏寶庫》（sdesnodmdzod）、《虛空藏寶庫》（nammkhavmdzod）和《格言寶庫》）。

夏扎大師所創立的夏扎日綽佛學院處今四川省德格縣北部溫託鄉（古名扎闊地區）一帶，由於這個地區從未處於交通要道，地理位置非常偏僻，一直到二十世紀末，這個地區才通簡易公路，而且需要騎馬才能穿梭在各個寺院中。康巴人寬闊的胸懷和博採眾長的優秀品格造就了康巴文化寬容的特點，尤其在近代受到利美運動（無偏私的佛教宗派融合）的影響下，長期以來各教派之間的關係相對比較融洽，加上該地區長期處於德格土司的管轄，而歷代德格土司教派觀念比較淡泊，使這裡的本教得以儲存和發展。此外，德格土司的轄區正好處於噶廈政府和四川軍閥兩大勢力範圍之間的一個緩衝地帶，這為本教這個處於劣勢的本土宗教提供了較大的活動空間。一直到二十世紀中葉，這個地方除了因交通不便而成為一個偏僻�