而肖天健在天元三年三月，下令調集善於在山地作戰的各路人馬共十萬餘人，對雲南永曆小朝廷發動了最後一擊，各路人馬兵分三路，從廣西、貴州、四川三地開始進兵雲南。

永曆小朝廷的軍隊根本無法抵抗兵強馬壯的大中軍，而且雲南各地土司也都接到了大中朝的聖諭，告知他們只要投順大中朝，今後對於他們這些土司會寬以對待，否則的話，大中軍一到，必令其灰飛煙滅。

這些土司也都不傻，眼巴前看著大明已經完了，僅剩下永曆小朝廷還在最後進行著微弱的抵抗，在雲南苟延殘喘，大中軍兵勢之強，也讓他們根本無法與之相抗，與其跟著永曆小朝廷，在大中軍來了之後被滅族，倒還不如倒戈趕緊找一條出路，對於中原王朝的更迭對於他們這些土司來說，影響不算是太大，只要他們表示順服，今後便還可以繼續給大中朝打工，所以雲南各地土司在這個時候也紛紛宣佈投順大中朝，並且集結土兵，幫著大中軍對付永曆小朝廷的軍隊。

結果是短短三個月的時間，永曆小朝廷的軍隊便紛紛被大中軍擊潰，降的降死的死，永曆帝也不得不捲鋪蓋繼續走人，眼看著中國境內已經基本上都被大中朝控制，他已經是逃無可逃，於是永曆帝便在幾百名忠心耿耿的侍衛的保護之下，從雲南逃入到了緬甸王國境內。

大中朝天元三年五月，雲南宣佈全境歸服大中朝，至此肖天健的大中朝也完成了對整個南方的控制，包括海南島在內，五月間大批大中軍海軍在雷州出發，渡海在海南島登陸，海南島上的瓊州府三州十三縣的官員心知無力反抗，於是一個月不到的時間，便紛紛宣佈歸降大中朝，接受大中朝的統治。

訊息傳到南京城之後，朝野頓時一片歡騰，每個人都長長的鬆了一口氣，奔走相慶，慶賀大中朝自此之後，總算是可以安穩下來了。

肖天健得知雲南和海南島都被收復的訊息之後，也立即開懷大笑了起來，當即便在宮中設宴慶祝，當晚險一些喝的酩酊大醉。

他之所以這麼高興，除了收復了整個南方諸省，平定了永曆之亂以外，還有幾件事情讓他非常高興。

一個就是去年他下旨籌建的大中朝南京太學院在年後終於在南京城外落成開始授課，第一批從全國各地遴選出了近八百名學子入學，成為了歷朝歷代規模最大的一次太學招生，而且今後每年還會繼續從全國招錄同樣數量的學子入學，學制四年，四年之後太學的生員數量將會達到三千人的規模，雖然這比起後世任何一座三流大學的學生數量都要少，但是這畢竟是剛剛起步，下一步北京太學院也將開課，招錄學子數量也會達到數百人之多，再有幾年時間，大中朝缺乏合適官員和專業人才的情況便會大幅緩解下來，為中國今後的興盛打下了基礎。

二一個好訊息就是在經過半年時間的籌備之後，中國海上貿易集團正式在廣州府成立了起來，按照肖天健當初和鄭芝龍約定的條件，朝廷戶部要拿出一些股本投入到集團公司之中，但是戶部眼下到處都是用錢的地方，根本無法一下便撥出這麼多資金投入進去，於是在肖天健的授意之下，戶部透過發行高利率債卷募集資金，輕鬆便募集到了三百萬兩白銀，摺合成大龍銀元也就是三百萬元，另外投入各種海船一百五十餘條，加上廣州、潮州、泉州、溫州、寧波、松江府、膠州、登州八處開埠所需的港口碼頭所需用地，透過折算之後，作為國家股本投入到了貿易集團之中，再加上鄭家三百萬兩白銀和一百二十條海船入股，以及另外共一百二十個商賈共同入股的五百萬兩白銀還有各種海船一百五十餘條，共同撐起了這個中國歷史上第一個官私合辦的集團公司，宣佈開始營業！

而且戶部所轄的海關總署也在年前成立起來，負責管理各地開埠港口進出口貿易事務，而且大中朝下旨宣佈禁止一切私人船隻，從