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萬曆的屍骨被輕輕地拿出棺外。儘管他的頭顱尚在，但今天的人們已無法和他對話，至於他生前的身體形狀、恩恩怨怨、悲歡離合以及生活習俗，只能間接地加以辨析，以求歷史的相對真實了。經北京口腔醫學院教授周大成鑑定，對於萬曆皇帝及兩位皇后的口腔和牙齒狀況，作出如下結論：

萬曆的口腔疾患較複雜，除患過嚴重的齲齒和牙周病之外，還有楔狀缺損、氟牙症、偏側咀嚼等症；孝靖後亦有很多齲齒和中等程度的牙周病；只有孝端後的牙齒比較健康。

三個頭骨所具備的共同特點是，牙齒的磨耗程度非常輕微，有的牙齒幾乎看不出磨耗的痕跡。據我國出土的一些材料證明，無論是北京猿人，山頂洞人，新石器時代人以及戰國時代人的牙齒頜面磨耗都相當嚴重，這是與他們的食物粗糙分不開的。而這三個頭骨牙齒的頜面磨耗如此輕微，足以說明他們的食物極為精細；也正是過細的食物，造成了他們的齲齒和牙周病。

第二個特點是，萬曆及孝靖後的一些牙齒上都有楔狀缺損，這是由於刷牙方法不合理所致。可見當時宮廷裡使用牙刷已相當普遍。

第三個特點是萬曆的氟牙症。中國最早的氟牙症化石實物是1978年5月在山西和河北交界處的許家窯村發現的。這是屬於舊石器時代中期的三個人牙化石，上面都有明顯的黃褐色小窩及斑點。據瞭解，今天生活在那裡的人，仍然都患有氟牙症。許家窯村人的氟牙症和萬曆帝的氟牙症極為相似。這在我國古代口腔疾病史上，是一項重要發現，淵源有待進一步查證。

經北京市公安局刑事科學技術研究所對萬曆和孝靖皇后殘存的頭髮鑑定，結論如下：

萬曆一束，孝靖一束。

萬曆一束為生前梳理時的脫髮，一束為屍體上所留。孝靖亦為屍體所留。

萬曆帝頭髮血型為AB型。

孝靖後頭發血型為B型。

注：孝端後殘存頭髮，同屍骨一起毀於文革，無從查證。

經中科院古脊椎動物與古人類研究所研究人員對萬曆屍骨的復原得出結論：

萬曆生前，體形上部為駝背。從骨骼測定，頭頂到左腳長1．64米。

璀璨的瑰寶

發掘人員揭開萬曆皇帝屍骨下已腐爛的綿褥，一個新的奇蹟出現了。巨大的棺內整齊密集地排列著一層織錦匹料，其色彩之絢麗，質地之華貴，前所未見，更撼人心魄的是，這層織錦品多達69卷。如此規模龐大的殉葬織錦珍品，不只國內前所未見，既使是在世界陵墓的出土中也屬罕見。

織錦各自成卷，在兩端和中間又各用一道絲線捆住，稱作“腰封”，中間捆線分開作人字形狀。人字形捆線下方，大都貼有方紙，紙上貼有織品的名稱、產地、匠作及織造年月，有的在年月上方蓋有硃紅色印章。由於長期埋藏於地下，紙上的文字大都模糊不清，發掘人員想盡辦法，但能辨認出來的仍是少數。

上用月白暗蒼龍雲肩通

袖龍欄直身袍暗線……

……雲地熟綾一疋長

五丈五尺四寸龍領全

南京供應機房織造

上用紗柘黃織金彩妝纏

枝連花托捌吉祥壹

匹寬貳尺長四丈

萬曆三十八年閆三月

萬曆二十六年

……山西……石勝保

明代的織錦業，在中華紡織工業史以及工藝美術史上，都曾大放異彩，佔有輝煌的篇章，並以其織工精細、色彩豔麗、品種繁